Dos son los espacios naturales protegidos con los que cuenta el municipio, el Parque Natural de la bahía de Cádiz y el Complejo Endorreico de El Puerto de Santa María.

Realmente en ambos casos es difícil practicar senderismo ya que están formados en la mayoría del terreno por marismas, pero si es posible en ellos ver por ejemplo flamencos u otras especies migratorias que vienen hasta aquí año tras año para descansar en sus largos viajes. El Complejo Endorreico, por ejemplo, se compone de tres lagunas, una de ellas, la más grande, salada.

Por otro lado, en cuanto a parques naturales debemos destacar el Parque Natural de la Bahía de Cádiz. En este Parque se entrelazan marismas, acantilados, zonas frondosas y, al igual que el Complejo Endorreico, un paso obligado para las aves migratorias.