Três são as paragens naturais de El Puerto de Santa Maria, incluídas na Rede de Espaços Protegidos de Andaluzia (RENPA). Em primeiro lugar, o Parque natural da baia de Cádis (o maior dos três espaços); em segundo lugar, o Complexo Endorreico de El Puerto de Santa Maria (este uma reserva natural); e, em terceiro lugar, os Pinhais e a Duna de Santo Antón.

O Parque natural da baia de Cádis é formado por quase 11.000 hectares protegidas desde 1989. Neste parque protegem-se as marismas, os arenais, as praias e pinhais e possui uma fauna e uma flora variada e rica. Quanto ao Complexo Endorreico, é composto por 300 hectares protegidas onde podemos encontrar aves aquáticas do tipo da Ánade Real e a Focha. pela sua parte, os pinhais e as dunas de Santo Antón foram declarados, há mai de uma década, espaço protegido da na Rede de Espaços Protegidos de Andaluzia (RENPA).